儘管政府一再向農民承諾，兩岸簽署兩岸經濟合作架構協議(ECFA)，不會增加大陸農產品進口，但仍無法完全消弭農民的疑慮。在台大舉辦的「ECFA對台灣政治社會影響」公共論壇中，學者指出，政府說帖中，只有說明大型企業放寬稅收等保護措施，卻沒有談到如何保證農民生活，使用的也不是農民了解的語言。行政部門應該要派員下鄉了解農民需求、組織文宣，「甚至可邀請最本土的顏清標來說明！」(陳映竹報導) 政大教授王振寰指出，由各項民調顯示，國人大多不懂ECFA，更不用說教育程度不高的鄉村農民，而農民的不懂，顯示執政團對無法用簡單易懂的方式和農民語言，讓他們了解。

王振寰說，反觀反對黨，用簡單語言、有用的政治語言，也是選舉可操作的簡單公式，把政府所作蓋過去，現階段政府講不明白，反而強化南北對立，更反映在這次三合一選舉，農業縣市國民黨大敗。王振寰建議，政府要使用農民理解的語言、並讓農民感到被保障。

簽署ECFA，就業衝擊也讓國人擔憂。台大國發所教授李碧涵認為，ECFA會帶動經濟成長，但不必然代表就業機會會增加。有許多新的就業機會被創造出，但更多走入歷史，造成更多低薪工作。李碧涵指出，政府必須提出確實補救措施，包括勞工轉業與再就業，短期經濟安全。台灣要走自己的路，沒必要像南韓，跟一堆國家簽署協議。